1. El control y monitoreo de sistema de rastreo de embarcaciones nacionales e internacionales.
2. La autorización de los zarpes y avisos de arribo a puerto.
3. La emisión de Alertas y declaratoria de Emergencias.
4. El traslado y notificación de las autorizaciones de abordaje emitidas al solicitante.
5. Establecer comunicación directa utilizando cualquier medio disponible con embarcaciones de bandera nacional y las extranjeras que naveguen en la jurisdicción Hondureña con el fin de dar instrucción, requerir información o identificarlas.
6. Dirigir y Coordinar las actividades de búsqueda y rescate junto con la Fuerza Naval de Honduras.
7. Notificar a las Capitanías de Puerto sobre toda Alerta o Emergencia emitida, así como instruir sobre actividades o medida que deban tomar en los puertos.
8. Iniciar el proceso administrativo cuando exista falla o incumplimiento de los sistemas de monitoreo y rastreo de embarcaciones.
9. Todas las que le sean asignadas por sus superiores jerárquicos.

1. La unidad de Análisis de Información e Investigación Marítima tiene la finalidad de realizar procesos analíticos basados en información de cualquier fuente y procedencia.
2. El análisis de los procedimientos empleados fortalecerá la credibilidad del sistema y proporcionará mecanismos y alternativas que coadyuven a agilizar y dinamizar los servicios prestados por la DGMM y la regulación y control marítimo que la Ley le otorga.
3. Realizar informes técnicos a toda embarcación, marinos, empresas dedicadas a las actividades marítimas que haya contravenido la Ley Orgánica de la Marina Mercante de Honduras.
4. Respuesta a Operadores de Justicia.

Esta Unidad tendrá la función específica de dirigir y coordinar todas las actividades propias del Convenio Internacional de 1965 así como sus enmiendas suscrito por los países integrantes de la Organización Marítima Internacional (OMI) conocido como Convenio FAL.

La Dirección General de la Marina Mercante cuenta con 13 Capitanías de Puerto en el territorio Nacional en los Puertos Mayores y Menores, bajo la responsabilidad del departamento de Capitanías de Puerto con sede en Tegucigalpa, Honduras con un Centro de Información Marítima las 24 horas y 365 días del año.